*Konohagakure
Konohagakure adalah nama sebuah desa fiksi dari serial anime dan manga Naruto. Konohagakure merupakan desa kelahiran Naruto Uzumaki, tokoh utama cerita ini, dan termasuk dari desa militer dengan elemen api. Desa ini adalah desa terkuat dari semua desa yang ada di dunia Naruto. Desa ini memiliki banyak ninja kuat. Pemimpin desa ini bergelar Hokage, dan konon sebutan ini merupakan salah satu sebutan yang diperuntukkan bagi kelima ninja legendaris yang dapat menggunakan satu dari lima element, yaitu api, air, tanah, angin, udara.Desa Konohagakure memiliki beberapa keistimewaan, misalnya tempat diselenggarakannya ujian Chunnin.
*Tanigakure
Beberapa tiga puluh tahun sebelum seri awal, Tani no sato telah menandatangani armstice dengan Daun Tersembunyi setelah periode perang. Hidden Valley Desa pindah untuk menyerang dan menyapu habis desa melemah. Tidak ada informasi yang diketahui tentang status desa ini. Karena Nanafushi dikatakan berasal dari negara, ketimbang desa, mungkin Hidden Valley tidak lagi beroperasi.
*Otogakure
Otogakure,berarti Desa Lindungan Bunyi atau Desa Oto, adalah nama sebuah desa fiktif yang terdapat dalam komik dan anime Naruto. Diceritakan, Otogakure adalah desa musuh bebuyutan Konoha. Desa ini didirikan oleh Orochimaru ketika melarikan diri dari konoha sebagai pusat penelitian terhadap teknik terlarang dan sarana militer buatnya. Walaupun baru berdiri, desa ini telah punya kekuatan militer yang sangat tangguh.Dari tempat ini,banyak shinobi dikumpulkan dari Klan Fuuma.Desa Otogakure pernah bersekongkol dengan Desa Sunagakure untuk menghancurkan Desa Konoha.
*Sunagakure
Sunagakure (砂隠れの里, Sunagakure no Sato?, berarti "Desa Pasir Tersembunyi" or "Desa yang tersembunyi dalam pasir") adalah nama sebuah desa fiktif yang terdapat dalam manga dan anime Naruto. Desa yang beraliansi dengan Konoha ini diberi gelar desa elemen pasir namun berda di desa angin sehingga banyak shinobi dari desa ini yang menggunakan teknik pasir dan angin. Pemimpin desa ini disebut sebagai Kazekage. Simbol dari desa mereka adalah jam waktu. Konon, Shukaku si ekor satu berasal dari desa ini.
Suatu ketika, para bangsawan Negara Angin, negara di mana desa ini berada, memutuskan untuk mengurangi anggaran militernya. Untuk menjaga agar desanya tetap kuat, Kazekage memutuskan untuk memperbaiki kualitas setiap ninja alih-alih menambah kuantitas prajuritnya. Gaara adalah salah satu produk dari keputusan tersebut.
Pengurangan anggaran ini ternyata tetap berdampak buruk bagi kekuatan militer Sunagakure. Banyak klien yang berpindah dan memilih untuk menyewa jasa ninja Konoha. Akibatnya, Kazekage berpendapat bahwa hal ini sangat mengancam eksistensi Suna. Ia pun beraliansi dengan Otogakure untuk menghancurkan Konoha sehingga klien dapat kembali memilih Suna. Namun penyerangan tersebut gagal akibat pengkhianatan Otogakure. Lebih jauh, Kazekage juga tewas. Hal ini menyebabkan Sunagakure balik beraliansi dengan Konoha. Dalam misi penyelamatan Sasuke, Sunagakure mengirim Gaara, Temari, dan Kankuro untuk membantu Konoha. Gaara kemudian menjadi Kazekage ke lima, menggantikan Kazekage sebelumnya yang tak lain adalah ayah dari Kankurou, Temari, dan Gaara.
Desa ini dominan terisi dengan pasir dan itu sangat menguntungkan Gaara, Kazekage sekaligus Jinchuuriki bijuu ekor satu, karena Gaara adalah seorang pengendali pasir. Desa ini tetap mendapat perhatian karena mempunyai ninja-ninja yang kuat. Akatsuki dari desa ini adalah Sasori.
*Takumi no Sato
Takumi no Sato adalah sebuah desa fiktif di Anime & Manga Naruto. Desa pengarajin ini bukanlah sebuah desa shinobi resmi. Empat pengrajin terampil yang terlatih dalam seni ninja memakai karakter Takumi pada dahi mereka pelindung dan berusaha membangkitkan pendiri desa mereka, Seimei. Mereka berencana untuk menggunakan kebangkitan untuk membalas dendam terhadap Shinobi Besar Lima Desa, yang mereka merasa tidak menghargai desa mereka.
Mereka beroperasi di bawah nama Shitenshounin, atau Empat Arah Surgawi. Nama ini berasal dari karakter dalam nama mereka sesuai dengan petunjuk dewa: Houki si Kura-Kura, Kujaku si Burung, Ryuugan si Naga dan Suiko si Macan.
*Kemurigakure
Kemurigakure no Sato berarti "Desa Tersembunyi di Asap". Debutnya di chapter khusus team 7 yang ingin tahu di balik topeng Kakashi. Muncul 3 orang dari Kemurigakure untuk membunuh kakashi namun selalu gagal.
*Kirigakure
Kirigakure (霧隠れの里, Kirigakure no Sato?, literally "Desa Kabut Tersembunyi") adalah nama sebuah desa fiksi dalam anime dan manga Naruto. Kirigakure terletak di Negara Air. Pemimpinnya disebut sebagai Mizukage. Kirigakure dijuluki sebagai desa air sebab kebanyakan shinobi di desa ini menggunakan elemen air sebagai jutsu mereka.Desa ini juga tempat tinggal jinchuuriki terdahulu dari Bijuu ekor 3,sebelum dilepas bebas dan akhirnya ditangkap Deidara dan Tobi. Di masa lalu, Kirigakure terkenal karena sistem kelulusan akademi ninjanya yang amat kejam. Sistem tersebut mengharuskan setiap calon lulusan untuk menyerang, melukai, bahkan membunuh teman-teman seangkatan mereka. Namun sistem ini akhirnya dihapus setelah seorang siswa bernama Zabuza Momochi berhasil membunuh seluruh siswa angkatannya dalam tes ini. Bersama dengan Kisame Hoshigaki dan Raiga Kurosuki, Zabuza termasuk dalam kelompok Tujuh Pemegang Pedang Ninja dari Desa Kabut, kelompok ninja terkuat di desa ini yang menggunakan pedang besar sebagai senjata andalannya.
*Kumogakure
Kumogakure ("desa tersembunyi di antara awan-awan") adalah sebuah nama desa fiksi anime dan manga dalam serial Naruto yang terletak di Negeri Petir. Sebagai bagian dari 5 desa terbesar ninja, Kumogakure mempunyai seorang kage, yaitu Raikage. Di masa lalu, saat Kumogakure dan Konohagakure sedang berperang, salah satu shinobi dari desa ini mencoba untuk menculik Hinata Hyuga, namun gagal dan berakhir dengan kematian ayah Neji.Suatu saat,ketika beberapa saat setelah Kushina(ibu Naruto)pindah ke Konoha,Kumogakure juga menculik Kushina karena chakranya istimewa.Tapi karena Minato menyadari jejak Kushina yang menjatuhkan rambut merahnya satu persatu,Minato berhasil menggagalkan penculikan itu. Pada umumnya, ninja Kumogakure menguasai elemen petir secara dominan. Terdapat juga jinchuuriki di Kumogakure, yaitu Yugito Nii, pemilik Nekomata (siluman berekor dua) yang berhasil ditangkap Akatsuki,dan juga jinchuuriki ekor 8,yaitu pria bernama Killerbee yang belum tertangkap Akatsuki.Di negara ini juga ada ninja yang bernama Samui, Karui, dan Omoi.
*Amegakure
Desa ini adalah salah satu desa yang memiliki sistem imigrasi yang ketat, desa ini pernah berperang dengan desa Konoha, pada suatu flashback. Pada waktu itu pemimpin desa Amegakure bernama Salamander Hanzou yang sangat kuat, bahkan melebihi Jiraiya, Tsunade dan Orochimaru. Pain, Ketua Akatsuki berasal dari sini, dan sekarang desa ini telah dipimpin oleh Pain. Saat kematian Pain, Konan menggantikan Pain.
*Hoshigakure
Desa ini mempunyai cakra dari bintang. Hokage ke-5 pernah mengirimkan misi ke Hoshigakure. Hokage ke-5 memerintahkan Naruto, Neji, Rock Lee, dan Tenten untuk menjaga bintang yang diincar shinobi desa lain. Disini Naruto bersahabat dengan shinobi Hoshigakure bernama Shumaru.Sebenarnya desa bintang ini mempunyai Kage,tetapi tidak resmi,karena Hoshigakure tidak termasuk 5 negara utama.
*Iwagakure
Desa ini merupakan desa fiktif di anime dan manga Naruto. Desa ini tersembunyi di antara bebatuan.Desa ini pernah berperang dengan Konoha dalam perang besar ninja ke-3. Ninja desa Iwagakure mengandalkan elemen tanah. Iwagakure mempunyai Kage yaitu Tsuchikage.Desa ini juga mempunyai 2 jinchuuriki.yaitu ekor 4 yang telah ditangkap Akatsuki, dan Ekor 5 yang juga sudah disegel.karena itu anggota akatsuki mengincarnya. beberapa shinobi dari negara ini adalah ninja yang memiliki teknik peladak seperti deidara.
*Soragakure
Soragakure no sato adalah desa fiktif di anime & manga Naruto. Soragakure no Sato berarti "desa tersembunyi di Langit" adalah latar dari Naruto the movie 5. Negara & desa ini memakai kecanggihan mesin terbang untuk ninja2nya. Negara ini pernah di kalahkan oleh Konohagakure. Di negara ini terdapat Ancor Vantian yang di ambil dari nama Angkor Wat
*Takigakure
Desa ini merupakan desa fiktif di dalam anime dan manga Naruto. Di desa ini juga terdapat shinobi yang bergabung dengan kelompok Akatsuki, yaitu sebuah kelompok antagonis di anime dan manga Naruto. Shinobi tersebut adalah Kakuzu. Selain itu, desa ini juga memiliki seorang Jinchuuriki ekor 7 yang bernama fū.
*Tonbogakure
Tonbogakure berarti "Desa tersembunyi di antara Capung". Debutnya muncul di anime filler. Penghuni terakhirnya adalah Gennou yang menyusup sebagai kuli bangunan dari Suna.
*Kusagakure
Desa ini juga merupakan desa fiktif yang ada di dalam anime dan manga Naruto. Desa ini tersembunyi di antara rerumputan yang luas. Tak banyak yang mengetahui tentang desa ini, tapi desa ini memiliki Shinobi yang masuk kelompok Akatsuki yaitu Zetsu. Desa ini juga masuk dalam cerita Naruto Jump Fiesta.
*Yugakure
Desa ini merupakan desa fiktif yang ada di dalam anime dan manga Naruto. Desa inilah yang hanya menganut agama Jashin adalah agama pemuja setan yang bersifat suka perkelahian. Selain itu, desa ini memiliki ninja Akatsuki yaitu Hidan. desa yugakure berada dia dalam negara singga
*Yukigakure
Yukigakure no Sato berarti "Desa Tersembunyi Di Salju" adalah latar dari Naruto the Movie 1. Diakhir cerita desa ini menjadi desa musim semi. dan desa ini akhirnya musnah karena prajurit-prejurit di desa ini dikalahkan oleh kelompok bandit-bandit. dan desa ini manjadi milik para bandit yang berencana akan menguasai dunia.
*Uzugakure
Desa ini merupakan desa fiktif di dalam anime dan manga Naruto. Semua orang yang berada di dalam desa ini merupakan keturunan Uzumaki. Selain itu, di desa ini adalah desa ibu Naruto yaitu Kushina Uzumaki. desa ini merupakan desa sahabat bagi konoha, tetapi karena serangan besar desa ini lenyap, untuk mengenang persahabatan konoha dan uzugakure, para shinobi dari konoha memakai lambang spiral pda begian belakang baju zirah mereka yang merupakan lambang dari desa uzugakure. Shinobi dari uzugakure juga terkenal dengan kemampuan teknik penyegelan yang sangat hebat.